Nissum Fjord og nogle af de omkringliggende arealer er udlagt som fuglereservat med et rigt og spændende fugleliv. Med beliggenheden på trækruten langs Vestkysten tiltrækker fjorden mange rastende fugle i for- og efteråret på deres rejse til og fra de arktiske yngleområder til vinteropholdsstederne i Syd- og Vesteuropa.
Fjorden er ikke blot en rasteplads, men også et vigtigt område for ynglende fugle. Derfor der er bestemte regler omkring færdsel på og omkring fjorden. Det er tilladt at windsurfe i Nissum Fjord i visse perioder og på visse områder.
En af de helt store oplevelser i Naturpark Nissum Fjord er fjordruten som går rundt om Nissum Fjord. Ruten er på 70 km afmærket rød rute som går gennem alle de små fjordhavne.