Møllen, der er en hollandsk mølle, er opført i 1838 og blev fredet i 1959. Oprindeligt lå her en dårligt indrettet stubmølle fra 1787.
Pumpemøllen blev bygget fordi man havde brug for at tørlægge Vitsø, der skulle bruges til landbrugsjord. I dag er en del af vådområdet genoprettet. Der var oprindeligt fem pumpemøller på Ærø, men denne er den eneste bevarede.
I 1937 blev et maskinhus bygget ved siden af møllen, og der blev installeret en 15 Hk »Søby«-motor fra den lokale Søby Motorfabrik. Den trak en centrifugalpumpe, som hjalp til med udpumpningen i vindstille perioder.
Der er offentlig adgang til møllen.