Trinitatis Kirke ved Rundetårn blev indviet i 1656 som kirke for universitetets professorer og studerende, men er i dag almindelig sognekirke.
Navnet henviser til Treenigheden – Gud, Søn og Helligånd – men også bygningskomplekset var oprindelig en treenighed af kirke, observatorium og universitetsbibliotek.
Kirkens indre blev hårdt medtaget ved Københavns brand i 1728 og bærer i dag præg af genopbygningen i 1731. Kirken rummer feltmarskal Hans Schacks gravmonument i marmor, mens digterne Johannes Ewald og Johan Herman Wessel ligger på den nu sløjfede kirkegård.
Søren Kierkegaards konfirmation
I 1829 blev Søren Kierkegaard konfirmeret i Trinitatis Kirken, idet Vor Frue Kirke var brændt ned. Præsten, der konfimerede den unge Kierkegaard, blev senere hen en af Kierkegaards største kritikere.
Der er gudstjeneste hver søndag klokken 10:30, og desuden foregår der en række andre begivenheder i kirken, blandt andet studentergudstjeneste og natkirke.