Godsets nuværende hovedbygning blev opført i 1681, men resterne fra Marsk Stigs gamle borg er velbevaret i hovedbygningens fundament, og er fortsat en betydningsfuld del af Møllerups Gods’ mangeårige historie. Sidefløjene og Hubertus Kroen stammer fra den første halvdel af 1700-tallet. Godset emmer af en lang historie, og de karakteristiske gule bindingsværkbygninger hensætter en til fortiden.
Rundvisninger arrangeres efter henvendelse til Møllerup Godskontor, og adgang til hestestaldene sker efter forudgående forespørgsel hos staldpersonalet.
Ferier, selskaber og konferencer kan arrangeres på Hubertus Kroen, som kan lejes som et stort feriehus. Kroen har plads til selskaber med op til 80 samt 30-40 overnattende gæster fordelt på 16 dobbeltværelser.