Vandet ved Bønnerup kan betegnes som fladfiskevand (skrubbe, ising og rødspætte), men det er også muligt at fange torsk og havørred. Vandet er lavvandet, hvorfor det er bedst at fiske fra molen eller fra båd. Havnen har en god rampe til søsætning, men vær opmærksom på at det er en betalingsrampe. Betaling skal ske til Havnefogeden. Havnen har også et skur med rindende vand og rensebord.