Kirken er formentlig opført omkring midten af 1100-tallet, bygget af rå og kløvede kampesten, og med hjørner og dørindfatninger af kvadre. Oprindeligt bestod Vistoft Kirke som andre romanske kirker af kor og skib. I første halvdel af 1500-tallet blev kirken mod syd udvidet med våbenhus og mod vest med et såkaldt ”styltetårn” (tårn med høj åbning mod vest). Samtidig blev indsat hvælving i koret. Skibet har fladt bjælkeloft.
Fra 1740-86 boede provst Erik Gjørup Begtrup i præstegården, som lå N for kirken. Han var en af de første privatpersoner her i landet, som anlagde prydhave. Endvidere var han foregangsmand indenfor både skole- og fattigvæsen samt landbrug.
Kirken gennemgik en omfattende istandsættelse og ombygning i 1774. Kirken blev restaureret igen i 1942, hvor flere kalkmalerier blev afdækket.
Kirkens gamle klokke fra 1300-tallet er bevaret, og der ringes stadig med denne ved gudstjenester og bryllupper. Klokken er en af de ældste i landet, da der kun er overleveret ganske få kirkeklokker fra middelalderen.
I tidligere tid var der eksercerplads ved kirken.
Præsten træffes ikke om mandagen.
Kirken er åben alle hverdage fra kl. 8-16. Kirken kan dog være lukket pga. kirkelige handlinger.