Sct. Mortens Kirkes udseende stammer fra en noget hårdhændet restaurering i midten af 1800-tallet.
Altertavlen er udført i 1667 af Abel Schrøder den Yngre og bærer præg af hans humoristiske sans. Prædikestolen er udført af Abel Schrøder den Ældre i 1602.
Kirken har mange gravminder, og der er 4 epitafier, som menes udført af Abel Schrøder den Yngre.