Klosterkirken er opført i 1400-tallet af munkesten.
Gråbrødrekirken, der i middelalderen var viet 'Vor Frue/Skt.Mikael/Skt.Frans', og i 1532 blev overladt byen til sognekirke.
Kirkens mest betydningsfulde inventar er:
Enkedronning Sophies 33 kvm store mecklenburgske anetavle. Danmarks største kirkeskat. Enkedronning Sophie var Nordeuropas rigeste kvinde ved sin død, og hendes lån finansierede bl.a. alle sønnens, Christian IV, byggeprojekter og krige.
Kirken har også et maleri af Lucas Cranach, samt et klokkespil med 26 klokker.
Der er mulighed for at høre F.H.Ramus-orgel fra 1858.